Η Μαργαρίτα Πρωτόπαππα-Sieke αποφοίτησε από την σχολή ΜΠΔ το έτος 2003 και απέκτησε Master of Industrial Systems Engineering από το Georgia Institute of Technology το έτος 2005  και Docteur ès sciences από το École Polytechnique Fédérale de Lausanne το έτος 2009. Μετά το διδακτορικό της συνέχισε την ακαδημαϊκή τής καριέρα ως Kαθηγήτρια σε Πανεπιστήμια της Γερμανίας. Το 2018 ξεκίνησε στη συμβουλευτική εταιρεία McKinsey & Co. στη Γερμανία όπου συμβουλεύει ένα ευρύ φάσμα εταιρειών σε διάφορους κλάδους, όπως αυτοκινητοβιομηχανίες, εταιρείες χημικών και καταναλωτικών αγαθών, εταιρείες ιατρικής τεχνολογίας, etc.